Graphical representation of interactions between protein and nucleic acid chains in PDB structure 1j2b

Protein chain - blue, nucleic acid chain - red.

Interactions between protein chain A and nucleic acid chain C



Protein Nucleic acid
418 (A) 909 (G)
419 (Q) 909 (G)
421 (E) 911 (U)
425 (D) 938 (G)
430 (K) 926 (C)
466 (T) 909 (G)
466 (T) 926 (C)
470 (R) 909 (G)
473 (K) 967 (C)
478 (R) 968 (G)
478 (R) 969 (G)
481 (T) 968 (G)
485 (D) 909 (G)
490 (T) 969 (G)
515 (E) 977 (A)
525 (D) 975 (C)
525 (D) 977 (A)
529 (K) 976 (C)
529 (K) 977 (A)
578 (R) 970 (G)

Interactions between protein chain A and nucleic acid chain D



Protein Nucleic acid
43 (K) 917 (U)
100 (Q) 916 (U)
100 (Q) 917 (U)
104 (Y) 917 (U)
130 (D) 915 (G)
136 (D) 933 (C)
136 (D) 940 (G)
202 (E) 912 (C)
208 (D) 938 (G)
249 (D) 915 (G)
251 (A) 915 (G)
252 (S) 914 (A)
256 (Y) 913 (U)
261 (R) 913 (U)
268 (T) 913 (U)

Interactions between protein chain B and nucleic acid chain C



Protein Nucleic acid
95 (D) 915 (G)
100 (Q) 916 (U)
130 (D) 915 (G)
136 (D) 933 (C)
169 (Q) 915 (G)
196 (G) 915 (G)
202 (E) 912 (C)
204 (Y) 912 (C)
204 (Y) 913 (U)
205 (R) 940 (G)
249 (D) 915 (G)
250 (S) 914 (A)
256 (Y) 913 (U)
261 (R) 913 (U)
268 (T) 913 (U)
339 (H) 911 (U)

Interactions between protein chain B and nucleic acid chain D



Protein Nucleic acid
367 (A) 911 (U)
418 (A) 909 (G)
425 (D) 938 (G)
464 (S) 908 (U)
465 (K) 949 (C)
466 (T) 909 (G)
466 (T) 926 (C)
478 (R) 967 (C)
481 (T) 968 (G)
525 (D) 977 (A)
579 (K) 968 (G)